Afsnit 7.8: Prædiktion på nyt datasæt

For data omkring LOI-værdien i søsedimenter i afsnit 7.5 brugte jeg kun hver sjette indsamlede prøve. Vi kan derfor bruge nogle af de resterende prøver som et testsæt til at vurdere den model, vi er kommet frem til. Nedenfor bruger jeg hver 24-ende prøve, startende med nummer 3. Hvor jeg i afsnit 7.6 beregnede en prædiktionsspredning baseret på leave one out crossvalidation, kan jeg her beregne en prædiktionsspredning baseret på de 22 prøver i testsættet. I kodevinduet nedenfor er vist beregningen for data omkring LOI-værdien i tilfældet med 14 forklarende variable fra forward selektion.

Se opstartskoden (til/fra)

Når I kører koden, vil I se, at prædiktionsspredningen fra det uafhængige testsæt er 5.6. Vi fandt tidligere at prædiktionsspredningen fra crossvalidation var 8.6, og spredningsskønnet var 5.6. Resultatet her er usædvanligt, normalt vil et testsæt give en prædiktionsspredning, der er over og mere ligner resultatet fra crossvalidation.
Figuren nedenfor viser den tidligere figur med spredningskøn (sort) og prædiktionsspredningen fra crossvalidation (rød), og hvor nu også prædiktionsspredningen fra det uafhængige testsæt er inkluderet (blå).
For data omkring LOI-værdien ser vi, at kurven (blå kurve) baseret på testsættet med 22 prøver generelt har et lidt overraskende forløb, idet den ligger under den sorte kurve i starten og ellers følger den sorte kurve. Ideen med crossvalidation er at efterligne et uafhængigt testsæt, hvorfor forventningen er, at den blå og røde kurve ville være sammenlignelige. En formodning kunne være, at testsættet ved en tilfældighed er meget tæt på træningssættet, men en beregning viser det samme resultat, hvis testsættet består af alle de oprindelige prøver, der ikke er medtaget i træningssættet (537-89 prøver). Det ser ud til, at når træningsættet indeholder prøver fra alle 6 søer, så vil vores model være god til at prædiktere nye prøver fra de samme søer. Omvendt, hvis en sø udelades fra træningssættet, så kan vi risikere at prædiktionen ikke er så god. Se i denne sammenhæng undersøgelserne i den oprindelige artikel: How well can near infrared reflectance spectroscopy (NIRS) measure sediment organic matter in multiple lakes?.
ForegåendeNæste